I 1866 blir ein merkeleg, dyreliknande skapning oppdaga i havet. Ein ekspedisjon under leiing av Professor Pierre Arronax får i oppdrag å finne ut kva det er. Ekspedisjonen grunnstøyter, og Professoren, Conseil og Ned Land blir tekne om bord i Nautilus. Som fangar blir dei med på ei eventyrleg og farefull reise under havet saman med den gåtefulle kaptein Nemo.